cientistas sequenciam o genoma de uma família

pesquisadores da Universidade de Utah sequenciaram pela primeira vez o genoma completo de uma família.
isso permitirá, entre outras coisas, uma estimativa mais acurada da taxa de mutação de diferentes regiões do genoma.
leia a entrevista completa aqui.

(via Marcos de Carvalho)

Follow Science: o FaceBook dos cientistas

recebi um email recentemente divulgando o Follow Science, um site de relacionamentos muito parecido com o FaceBook, mas com alguns aplicativos diferenciados, voltados para o publico "nerd", o de cientistas.
conforme o próprio site deles, o "Follow Science é uma rede social voltada a estudantes, pesquisadores e profissionais em geral, (...) um espaço colaborativo para a divulgação de eventos acadêmicos, publicação de artigos científicos, notícias e textos informais. Junte-se a nós e divulgue os eventos e periódicos que você conhece, descubra várias oportunidades nacionais e internacionais, e aproveite pra entrar em contato com pessoas que compartilham o mesmo interesse que você."

eu acabei de criar um perfil, mas ainda não aprendi a usar nada. alguém já tentou? será que pega?

eventos: Povoamento das Américas

entre os dias 22 e 26 de Novembro de 2010 acontecerá em La Plata, Argentina, o V Simpósio Internacional: O Povoamento das Américas. o congresso tem sido realizado a cada dois anos, desde 2002, na Cidade do México, México. neste ano, o congresso será dedicado ao estudo da influência dos estudos de A. Hrdlicka no debate antropológico contemporâneo.
até o dia 30 de Abril, o congresso aceita trabalhos em todas as áreas da antropologia, desde variação genética e morfológica, arqueologia, biologia, bem como trabalhos históricos sobre o desenvolvimento do pensamento acerca do povoamento do continente americano. maiores informações podem ser acessadas no site do evento.

faca de dois gumes

a empresa Complete Genomics pretende sequenciar um milhão de genomas humanos nos próximos 5 anos (5 mil genomas humanos deverão ser sequenciados em 2010).

http://singularityhub.com/2010/01/26/exclusive-complete-genomics-to-sequence-1-million-genomes-interview-with-ceo/

recebi um email com essas informações. junto com o link, vinha uma série de questionamentos acerca do caminho da pesquisa genética brasileira. 

vivemos numa época em que a geração de dados não é mais o problema limitante. de fato, várias revistas jah disponibilizam gratuitamente todos os bancos de dados utilizados em suas publicações.

a questão limitante nos dias de hoje é a dificuldade de manipulação e analise de grandes bancos de dados. se para alguns a análise de uma pequena seqüência de DNAmt já é uma tarefa difícil, imagine a dificuldade de se analisar o genoma de 5 mil humanos de uma só vez.

eu percebo uma ligeira mudança no comportamento de alguns geneticistas com relação a isso, principalmente de alguns mais próximos a mim.

o email enviado por um colega terminava com as seguintes perguntas:  

"O que irá representar analisar poucos locus enquanto milhares de genomas estão disponíveis para complementar informações de experimentos locais? Como incorporar informações funcionais aos dados genômicos? Que metodologias são relevantes para interpretação de dados experimentais a fim de complementar os dados de sequenciamento? Como deverão ser feitos estudos de associação com  um milhão de genomas? Como correlacionar frequencias de SNPs em milhares de locus e milhares de gnomas?"

a história genética global de nossa espécie

a Current Biology lançou uma edição especial intitulada "Global Genetic History of Homo sapiens: Special Review Issue". para acessá-la, clique aqui.

a edição conta com sete artigos, um sobre cada continente do globo e um artigo final sobre adaptação.

o sexto artigo, de autoria de Dennis H. O'Rourke e Jennifer A. Raff, trata da questão do povoamento das Américas (clique aquí para acessar o artigo na íntegra).

os autores realizam uma breve revisão incluindo os artigos mais recentes sobre o tema com o uso de marcadores autossômicos e do material genético haplóide (cromossomo Y e DNA mitocondrial).

em poucos parágrafos, também discutem o problema do haplogrupo* X2a do DNAmt, sobre o qual muito se tem debatido. alguns autores, como ressaltam O´Rourke e Raff, acreditam que esse haplogrupo tenha sido trazido por uma onda migratória distinta daquela que trouxe os demais haplogrupos ameríndios. porém, isso não é consensual. um grupo de pesquisadores Brasileiros, por exemplo, evidenciam que uma onda migratória é suficiente para explicar toda a diversidade genética dos haplogrupos encontrados no continente.

o artigo é curto e, apesar de não aprofundar nos assuntos, vale a pena ser lido. como toda revisão, funciona para irmos buscar maiores detalhes em outros trabalhos citados ao longo do texto.

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*nomenclatura: "haplogrupo" é o nome que se dá a um conjunto de moléculas de DNA proximamente aparentadas, com trajetória evolutiva compartilhada e com mutações em comum. Nas Américas, por exemplo, existem 5 haplogrupos de DNA mitocondrial (DNAmt). A partir de análises genéticas em busca de mutações-chave, é possível identificar o haplogrupo de uma molécula de DNAmt. A partir disso, é possível encontrar a origem geográfica de uma molécula e também é possível relacioná-la filogeneticamente a outro DNAmt.